По решению краевого отделения общества Красного креста,  для подготовки  среднего и младшего медперсонала, в 1968году на базе больницы города Анапы были открыты  двухгодичные курсы по подготовке медицинских сестер. Занятия проводились в двух кабинетах, пристроенных по инициативе главного врача Петрова Николая Ивановича, к старому (1913 года) зданию стоматологического отделения, которое находилось за городской поликлиникой.

В 1970 году, по настоянию Петрова Николая Ивановича главного врача Анапской городской больницы открывается филиал Новороссийского медицинского училища.

Возглавила руководство филиалом Валентина Трофимовна Дворникова, на этом посту она проработала более 30 лет.

В 1983 году училище занимало уже 7 кабинетов, также были учебные комнаты в родильном и хирургическом отделении Центральной районной больницы.

Петров Н.И. и Дворникова В.Т. создали высоко профессиональный преподавательский коллектив, своим почетным долгом считали работу в училище многие врачи больницы. В разное время в медицинском училище преподавали Стефаненко С., Антонова Д., Стасенок А., Дзыба Н., Крывуля В., Лавник О., Кульченко М., Аверьянова С., Лобов В., Лобова В. и др.

В 2000 году увеличивается срок обучения студентов до трех лет, возобновляет свою работу вечернее отделение. Многие выпускники Анапского филиала продолжили обучение в ВУЗах и посвятили себя медицине.

Выпускница 1984 года Анапского филиала колледжа Лариса Викторовна Щукина, поступила и окончила Донецкий медицинский институт в 1990 году. Закончив интернатуру по инфекционным болезням проработала 11 лет в областной клинической больнице города Донецка и спустя 17 лет вернулась в  город Анапу, став заведующим Анапским филиалом колледжа. 

С 2002 по 2011 год, в период руководством Ларисы Викторовны Анапский филиал продолжает улучшать свою материально техническую базу:

                -2005 год на территории городской больницы специально для медицинского колледжа было построено здание, куда и переехал филиал;

                - 2006 год открывается отделение дополнительного образования, где работающие медицинские сестры повышают свою квалификацию;

                -2010 год начинается прием на учебу выпускников девятых классов, срок обучения для которых составляет 4 года.

Сегодня Анапский филиал – самый крупный из трех филиалов Новороссийского медицинского колледжа, в нем обучаются более 240 студентов,  работают 16 штатных преподавателей и около 20 совместителей.